Lab Services : Environmental & Industry / Lingkungan & Industri

1. Microbiology of Water

Preliminary examination to determine the next identification.

Aim

  • Microbiological examination of water quality
  • Interpreting microbiology result of water examination

Sample Type

  • Drinking water
  • PDAM
  • Swimming pool water
  • Tap Water
  • Well water
  • River water

How to Collect Water Sample?

A. Natural Water

1. Shallow river

  • Use a clean 500 ml wide mouth bottle
  • Sampling direction against the river flow and 10 cm below the surface.
  • The water is directly put into the bottle.

2. Deep river

  • Water is taken from the middle of the river, at least 1.5 m from both sides
  • Using a ballast on the sample bottle, water is taken 30 cm below the surface.

3. For a wide river

  • Water is taken from 3 places: the middle and both sides

4. Lake

  • Water is taken in the middle, at least 1.5 m from the edge and 50 cm from the surface.

5. Rainwater

  • water is taken from the rainwater reservoir.

6. Well

  • Use a bottle with a ballast and water is taken from the inside of the well.

B. Water Pipe

  • Before taking specimens, technicians wash their hands first using 70 alcohol%.
  • To get water from the main pipe, open the faucet and let the water flow for 5-10 minutes then collect it with a bottle
  • Clean the faucet with disinfectant
  • Faucet is fully opened, run 2-3 minutes or is considered sufficient for clean the faucet mouth, then close it again.
  • Bunsen is lit with a match, using tweezers, cotton is dipped in spiritus and burned. Then the faucet mouth heated using the cotton until the water vapor comes out
  • Open the sample vial from the protective paper (open only halfway to avoid contamination). The bottle cap and protective paper are taken as a unit and held between the fingers. Collection must be carried out aseptically.
  • The wide-mouthed bottle is heated to a moderate temperature
  • Bottles filled with water samples are ± 2.5 cm from the mouth of the faucet until the volume fills ¾ bottle
  • The mouth of the bottle is reheated to hot and closed immediately.
  • Bunsen is turned off with the lid
  • Bottles are labeled and put in a cool box
  • Immediately sent to the laboratory for processing

Please Note

  • When checking water at a location, all water sources must be inspected, for example wells, water tanks, and water in pipelines
  • If the water has been chlorinated, it should be neutralized by adding hyposulphite or sodium thiosulfate immediately after sampling.
  • The bottle must not be fully filled, if at the time of collection (eg well water) the bottle is full, then remove some of the water
  • Put a label on the bottle that says: origin of water, address of collection and time of collection (hour, day & date).
  • If transportation to the laboratory takes more than 6 hours, the sample is put in a cooler with a temperature of 8-10oC.

Microbiology Examination of Water:

  • Total Plate Count (TPC): Count the number of colonies that describe the number of bacteria per ml of water sample.
  • Most Probable Number (MPN): Consists of presumptive, confirmation and complete tests to determine the number and types of water polluting bacteria.

2. Microbiology of Air

Every room in the hospital has a different tolerance limit for bacteria. WHO and the Ministry of Health of the Republic of Indonesia have issued a standard regarding the number of bacteria that can still be tolerated by individuals in each type of room in a hospital/office in the form of an index of microorganism numbers according to room or unit function.

Aim

  • Checking the air quality in certain rooms
  • Checking the sterility of the object's surface
  • Check the sterility of solid / liquid substances

Sample Type

  • Air bacteria
  • The surface of an object and a solid or liquid

How to Take Sample

1. Air Bacteria

  • The room to be inspected is calculated by volume
  • The number of sample points to count is 10% of the volume of each room.
  • At one point 1000 ml of air was taken for 10 minutes using an air sampler (See use in the use of Manual Guide of Air Sampler from Merck)
  • For 10 minutes, 4 plates are used for nutrition for 2.5 minutes each​
  • Colonies of bacteria growing on nutrient agar were counted using a colony counter

2. Surface of a tool/solid/liquid

Surface inspection of a tool

  • Wipe the surface of the tool or the material (at least with 2 swabs) to be examined using culture medium, observed every day for 2 weeks. ​
  • Growth was observed, Gram staining and identification using biochemical tests were performedII.

Examination of solids/liquids

  • One milliliter/1 gram of each sample was put into the culture medium
  • Incubated for 18-24 hours, observed for growth, performed Gram stain and identified using biochemical tests

3. Microbiology of Food

To prove food as the cause of infection and also to meet the requirements of microbiological quality of food set by the POM, Ministry of Health of Indonesian Republic

Aim

  • Finding the microbe that causes infection in food
  • Interpreting the results of microbiological examination of food inspection

Sample Type

  • Food

How to Take Food Samples

1) The examining officer takes the sample to be examined. In the event of an outbreak of food poisoning, in addition to the suspected food, specimens from the patient are also examined, namely:

  • Feces. At least 1 gram of feces is needed.
  • Vomit is taken as much as possible on the part that is not contaminated, put it in a plastic bag and send it to the laboratory.
  • Blood. Sampling, delivery and inspection according to SOP for blood tests.

2) In order to determine the source of infection from an outbreak it is necessary to check:

  • Feces of people handling food (cooks or food preparers)
  • Pus from food handlers (if any)
  • Samples were also taken from the environment, for example: swabs for cooking utensils. Sometimes it is also necessary to examine the feces of people who also eat these foods even though they are not sick.

3) Inspection officers carry out inspections according to requests. Type of Examination can be:

  • Total Plate Count (TPC)
  • Most Probable Number (MPN) Double Tube Method (9 tube): Presumptive Test & Confirmation Test
  • Pathogenic bacteria examination:

4. Percentage Kill

Microbiological examination to determine the effectiveness of the antiseptic.

Aim

  • Determine the Percentage Kill value
  • Interpret the results of the Percentage Kill test

Sample Type

  • Antiseptic

Checked Sample

General soaps/commercial facial cleansers related to skin health.

  • Type of inspection: (A). Determination Colony Forming Unit (CFU) and (B). Determination of Percentage Kill
  • A good kill percentage ( % ) is more than 90% for each contact time.

5. Phenol coefficient:

Microbiological examination to assess antiseptic/disinfectant potency

Aim

  • Determine the value of the Phenol Coefficient
  • Interpreting the results of the Phenol Coefficient test

Sample Type

  • Antiseptic and disinfectant
  • If the result of the phenol coefficient ≥ 1: the disinfectant meets the criteria for use

6. Challenge Test

Disinfectants/antiseptics that have passed the microbiological feasibility test can be continued with the Challenge test which aims to determine their resistance to microorganisms. The challenge test is carried out by giving a number of microorganisms to the examination material and analyzing the growth of these microbes.

Aim

  • Determine the Challenge Test scores
  • Interpreting Challenge Test results

Sample Type

  • Antiseptic dan disinfectant

Result Interpretation

  • Microbes that grow should not be more than 0.01%.
  • Challenge Test scores that meet the criteria are: < 99.9%.​

1. Mikrobiologi Air

Pemeriksaan awal untuk menentukan identifikasi berikutnya.

Tujuan

  • Memeriksa kualitas air secara mikrobiologi
  • Menginterpretasikan hasil uji mikrobiologi pemeriksaan air

Jenis Sampel

  • Air minum
  • PDAM
  • Air kolam renang
  • Air keran
  • Air sumur
  • Air sungai

Cara mengambil sampel air

A. Air Alam

1. Sungai dangkal

  • Gunakan botol bersih 500 ml bermulut lebar.
  • Arah pengambilan sampel melawan arus sungai dan 10 cm dibawah permukaan.
  • Air langsung dimasukkan kedalam botol.

2. Sungai dalam

  • Air diambil pada bagian tengah sungai, minimal 1,5 m dari kedua tepinya.
  • Dengan menggunakan pemberat pada botol sampel, air diambil 30 cm dibawah permukaan.

3. Untuk sungai yang lebar

  • Air diambil dari 3 tempat: bagian tengah dan kedua tepinya.

4. Danau

  • Air diambil dibagian tengah, minimal 1,5 m dari tepi dan 50 cm dari permukaan.

5. Rainwater

  • Air diambil dari bak penampung air hujan.

6. Well

  • Gunakan botol dengan pemberat dan air diambil dari bagian dalam sumur.

B. Pipa Air

  • Sebelum pengambilan spesimen, teknisi mencuci tangan terlebih dahulu menggunakan alkohol 70%.
  • Untuk mengambil air dari pipa utama, buka keran dan biarkan air mengalir selama 5-10 menit lalu kumpulkan dengan botol.
  • Bersihkan kran dengan desinfektan
  • Kran dibuka penuh, alirkan 2-3 menit atau dianggap cukup untuk membersihkan mulut kran, kemudian ditutup kembali.
  • Bunsen dinyalakan dengan korek api, dengan menggunakan pinset, kapas dicelupkan kedalam spiritus dan dibakar. Kemudian mulut kran dipanaskan dengan kapas, hingga keluar uap air.
  • Buka botol sampel dari kertas pelindung (dibuka sampai setengah saja untuk menghindari kontaminasi). Tutup botol dan kertas pelindung diambil sebagai satu kesatuan dan dipegang antara jari-jari tangan. Pengambilan dilakukan secara aseptis.
  • Botol bermulut lebar dipanasi hingga cukup panas
  • Botol diisi sampel air berjarak ± 2,5 cm dari mulut kran hingga volume memenuhi ¾ botol
  • Mulut botol dipanasi kembali hingga panas dan ditutup secepatnya.
  • Bunsen dimatikan dengan penutupnya
  • Botol diberi label dan dimasukkan ke dalam cool box
  • Segera dikirim ke laboratorium untuk diproses

Perlu Diperhatikan

  • Untuk pemeriksaan air di suatu lokasi, maka semua sumber harus diperiksa, misalnya sumur, tanki air, dan air dalam pipa saluran​
  • Apabila air telah diklorinasi, maka air harus dinetralkan dengan penambahan hyposulphit atau natrium thiosulfat segera setelah pengambilan sampel
  • Botol tidak boleh diisi penuh, bila saat pengambilan (mis. air sumur) botol terisi penuh maka keluarkan sebagian air
  • Beri label pada botol yang bertuliskan: asal air, alamat pengambilan dan waktu pengambilan (jam, hari & tanggal).
  • Bila transportasi ke lab memerlukan waktu > 6 jam, sampel dimasukkan kedalam kotak pendingin dengan suhu 8-10oC.

Pemeriksaan Mikrobiologi Air

  • Total Plate Count (TPC): Perhitungan jumlah koloni yang menggambarkan jumlah bakteri tiap ml sampel air.
  • Most Probable Number (MPN): Terdiri dari uji presumtif, konfirmasi dan uji lengkap untuk mengetahui jumlah dan jenis bakteri pencemar air.

2. Mikrobiologi Udara

Setiap ruangan yang ada di rumah sakit memiliki batas toleransi bakteri yang berbeda-beda. WHO dan Departemen Kesehatan RI telah mengeluarkan standar mengenai jumlah bakteri yang masih dapat ditoleransi oleh individu pada setiap ruangan yang ada di rumah sakit/perkantoran berupa indeks angka mikroorganisme menurut fungsi ruang/unit.

Tujuan

  • Memeriksa kualitas udara pada ruangan tertentu
  • Memeriksa sterilitas permukaan benda
  • Memeriksa sterilitas zat padat/zat cair

Jenis Sampel

  • Bakteri udara
  • Permukaan benda dan suatu zat padat atau cair

Cara Mengambil Sampel

1. Bakteri Udara

  • Volume ruangan yang akan diperiksa dihitung volumenya
  • Jumlah titik sampel untuk dihitung sebesar 10% dari volume tiap ruangan.
  • Pada satu titik diambil 1000 ml udara selama 10 menit menggunakan air sampler (Lihat penggunaan pada Manual Guide of Air Sampler dari Merck)
  • Dalam 10 menit, digunakan 4 plat agar nutrisi masing-masing selama 2,5 menit
  • Koloni-koloni bakteri yang tumbuh pada agar nutrisi dihitung menggunakan colony counter.

2. Permukaan suatu alat/zat padat/ zat cair

Pemeriksaan permukaan suatu alat

  • Usap permukaan alat/bahan (minimal dengan 2 swab) yang akan diperiksa menggunakan medium biakan, diobservasi setiap hari selama 2 minggu.
  • Pertumbuhan diamati, dilakukan pewarnaan Gram dan identifikasi menggunakan uji biokimia.

Pemeriksaan zat padat/cairan

  • Satu mililiter/1 gram sampel masing-masing dimasukkan ke dalam medium biakan
  • Dinkubasi selama 18-24 jam, diamati pertumbuhannya, dilakukan pewarnaan Gram dan identifikasi menggunakan uji biokimia.

3. Microbiologi Makanan

Membuktikan makanan sebagai penyebab infeksi dan juga untuk memenuhi persyaratan kualitas makanan secara mikrobiologi yang ditetapkan oleh Badan POM, DEPKES.

Tujuan

  • Menemukan mikroba penyebab infeksi pada makanan
  • Menginterpretasikan hasil pengujian mikrobiologi pemeriksaan makanan​

Jenis Sampel

  • Makanan

Cara mengambil sampel makanan:

1) Petugas pemeriksa mengambil sampel yang akan diperiksa. Apabila terjadi wabah keracunan makanan, selain makanan yang dicurigai diperiksa juga spesimen dari penderita yaitu berupa:

  • Feses. Paling sedikit dibutuhkan 1 gram feses.
  • Muntahan diambil sebanyak mungkin pada bagian yang tidak tercemar, masukkan ke kantong plastik dan kirim ke laboratorium.​
  • Darah. Pengambilan sampel, pengiriman dan pemeriksaan sesuai dengan SOP pemeriksaan darah.

2) Untuk mengetahui sumber infeksi dari suatu wabah harus diperiksa:

  • Feses orang yang menangani makanan (koki / peracik makanan)
  • Pus dari luka orang yang menangani makanan (bila ada)
  • Sampel juga diambil dari lingkungan, misalnya : swab alat-alat masak. Kadang juga perlu memeriksa feses orang-orang yang juga memakan makanan tersebut meskipun tidak menderita sakit.

3) Petugas pemeriksa melakukan pemeriksaan sesuai dengan permintaan. Jenis pemeriksaan dapat berupa:

  • Total Plate Count (TPC)
  • Most Probable Number (MPN) Metode Tabung Ganda (9 tabung): Uji Presumtif & Uji Konfirmasi
  • Pemeriksaan bakteri patogen:

4. Percentage Kill

Pemeriksaan mikrobiologi untuk menentukan efektifitas antiseptik.

Tujuan

  • Menentukan nilai Percentage Kill
  • Menginterpretasikan hasil uji Percentage Kill

Jenis Sampel

  • Antiseptik

Sampel yang Diperiksa

Umumnya sabun-sabun/pembersih wajah komersial yang berhubungan dengan kesehatam kulit.

  • Jenis pemeriksaan: (A). Penentuan Colony Forming Unit (CFU) dan (B). Penentuan Percentage Kill
  • Hasil persentase Kill ( % ) yang baik adalah > 90 % untuk tiap waktu kontak.

5. Koefisien Fenol

Pemeriksaan mikrobiologi untuk menilai potensi antiseptic/disinfektan

Tujuan

  • Menentukan nilai Koefisien Fenol
  • Menginterpretasikan hasil uji Koefisien Fenol

Jenis Sampel

  • Antiseptik dan disinfektan
  • Jika hasil koefisien fenol ≥ 1 : disinfektan memenuhi kriteria untuk digunakan.

6. Challenge Test

Disinfektan/Antiseptik yang telah melalui uji kelayakan mikrobiologi dapat dilanjutkan dengan Challenge test yang bertujuan untuk mengetahui daya tahannya terhadap mikroorganisme. Challenge test dilakukan dengan memberikan mikroorganisme pada bahan pemeriksaan dan menganalisa pertumbuhan mikroba tersebut.

Tujuan

  • Menentukan nilai Challenge Test
  • Menginterpretasikan hasil uji Challenge Test

Jenis Sampel

  • Antiseptik dan disinfektan

Interpretasi hasil:

  • Mikroba yang tumbuh tidak boleh lebih dari 0,01 %.
  • Nilai Chalange Test yang memenuhi kriteria adalah : < 99,9 %.

Location Address

Jl. Pegangsaan Timur no. 16, Cikini
Jakarta Pusat, 10320

Phone : (021) 3160491-2, 31922850, 3100806
email: lmk.fkui.rscm[at]gmail.com

WhatsApp Hotline 1 (Office Hours)
WhatsApp Hotline 2 (08.00 - 22.00)

Service Hours

Monday-Friday:
08.00 to 18.00

Saturday:
08.00 to 12.00

Links

© 2022. UKK PPM Laboratorium Mikrobiologi Klinik, Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia